Представитель могущественного клана Хюга из Деревни Скрытого Листа, обладающий редким доудзюцу — бьякуганом, отличающим членов клана особым зрением. Клан Хюга издавна делился на две ветви: главную, наделённую всей властью, и побочную, чья обязанность — защищать основную. Нэджи, несмотря на свой уникальный талант и выдающиеся способности, принадлежит к побочной ветви и потому не может претендовать на лидерство в клане. Его лоб отмечен «печатью подчинения», что стало следствием того, что его отец, Хизаши, родился чуть позже своего брата-близнеца Хиаши — будущего главы клана.

С юности Нэджи демонстрировал невероятную силу и считался настоящим гением. В академии он был лучшим учеником, благодаря чему попал в команду с Роком Ли и Тэн-Тэн под началом дзёнина Майто Гая. Несмотря на некоторые напряжения в отношениях, особенно с Ли, команда действовала слаженно. На экзамене на звание тюнина, особенно в поединке с двоюродной сестрой Хинатой, проявилась убеждённость Нэджи в жестокости судьбы. Он верил, что участь каждого человека предрешена, и гениальность или неудача даны от рождения.

Переломным моментом стало его сражение с Наруто и последующий разговор с Хиаши. Эти события заставили Нэджи пересмотреть свои взгляды, избавиться от обиды на главную ветвь клана и примириться с собственным прошлым. Его характер стал мягче, а отношения с Хинатой наладились. В дальнейшем он продолжал выполнять миссии в составе своей команды, а позже получил звание дзёнина.

Во время Четвёртой Мировой Войны Шиноби Нэджи отдал свою жизнь, прикрыв собой Хинату и Наруто от смертельной атаки Обито Учихи, тем самым подтвердив свою преданность и героизм.